日本自江戸時代起，農暦5月5日端午節「端午の節句（たんごのせっく）」，同時也是日本的男兒節。明治維新後改到西暦5月5日。1948年才定為「こどもの日」（兒童之日），旨在「重視兒童人格，關注兒童幸福，同時感謝母親」。
傳統上有不少習俗，有男孩的家庭會在屋頂或露台掛上鯉魚旗「鯉のぼり（こいのぼり）」，代表家族興旺和鯉躍龍門。端午當天會吃「柏餅（かしわもち）」。更加講究的家庭會在家擺上「五月人形（ごがつにんぎょう）」等。
鯉魚旗的顏色和位置有不同意義，上方黑鯉代表父親，紅鯉或粉鯉代表母親，下方其他顏色鯉魚代表子女。
柏餅是用柏葉包裹糯米和豆沙等餡料做成的點心。由於柏樹是出了新芽，老葉才會掉落，吃柏餅寓意家系延綿不絕，永續繁衍。此外也會吃粽（ちまき），這是從中國傳入的習俗，但粽的外形多數是長錐形，口感更像和菓子。
端午節又叫「菖蒲の節句（しょうぶのせっく）」，日本人習慣懸掛「菖蒲（しょうぶ）」辟邪，「菖蒲」和「尚武」同音，因此自鎌倉時代起這節日深受武家重視，祈求將來要繼承家業的男孩平安成長。這也是端午節跟男兒節連繫起來的原因。
有些家庭會在家中擺放「五月人形」。這是「鎧（よろい）」鎧甲與「兜（かぶと）」頭盔的裝飾品，或是穿上這些武具的公仔。鎧兜象徴保護男孩的身體，祈求健康成長。